Nature Communications | 我院胡家志实验室揭示线粒体DNA片段可广泛整合入核基因组
2024年11月1日，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心、北京大学成都前沿交叉生物技术研究院胡家志实验室及合作者在Nature Communications发表了标题为：Transfer of mitochondrial DNA into the nuclear genome during induced DNA breaks的研究论文。该项研究中作者采用实验室前期开发的用于系统分析基因编辑产物的高通量测序方法——PEM-seq1，发现在核基因组编辑过程中，线粒体DNA片段可能插入到靶向位点，与此...
【Chemical Science】我院王初实验室发展了一种高效的EVs蛋白质组学分析流程用于结直肠癌的早筛早诊
近日，北京大学化学与分子工程学院、北大-清华生命科学联合中心、北京大学成都前沿交叉生物技术研究院王初实验室与北医三院林坚课题组、北京大学首钢医院顾晋课题组在Chemical Science杂志上合作发表了题为“A simplified and efficient extracellular vesicle-based proteomics strategy for early diagnosis of colorectal cancer”的研究文章。在这项工作中，作者们建立并优化了一种高效的胞外囊泡（Extracellular vesicles...
【Angew】来鲁华/张长胜团队在全原子蛋白质序列设计中取得新进展
——背景——针对蛋白质结构骨架的序列设计是全新蛋白质设计中的关键问题之一。近年来，随着深度学习方法和技术的发展，全新蛋白质序列设计取得了重要进展。其中代表性的工作包括ProteinMPNN，ABACUS-R，ProDesign-LE等，都在序列设计中取得了重要进展，并进行了相应的实验验证。然而，这些代表性的方法均没有考虑蛋白质侧链的原子细节信息。一方面，蛋白质侧链构象对蛋白质执行功能具有重要作用。另一方面，大量的序列设计算法...
Cell Systems | 我院林一瀚实验室探究基因调控系统中“记忆”的规律原理与干预策略
生命科学发展的重要途径之一，是通过生命系统的定量解析，提炼运作规律及设计原理，以实现复杂生命系统的可预测干预、设计、及合成。在生命系统中，基因调控网络“指挥”着发育、免疫等关键生命过程，定量研究基因调控网络对于复杂生命系统的理解与干预有着重要意义。我院在基因调控网络领域有着长期的研究积累，院内研究团队在过去研究中已凝练出了基因调控网络中的一系列定量规律及设计原理，这些规律原理对合成基因线路设计...
喜报 | 祝贺我院伊成器教授、刘志博教授荣获第六届“科学探索奖”
祝贺我院伊成器教授、刘志博教授分别在医学科学领域、化学新材料领域荣获第六届“科学探索奖”！“科学探索奖”的初衷是支持青年科技工作者勇攀科学高峰。作为腾讯践行可持续社会价值创新、支持基础科研的重要探索，“科学探索奖”将恪守“科技向善”理念，持续加强对青年科技人才的支持。伊成器北京大学博雅特聘教授北大-清华生命科学联合中心研究员国家杰出青年基金及其延续资助获得者万人计划领军人才海外高层次人才引进计划...
Nature Methods | 我院何爱彬团队开发单细胞药物基因组靶点检测新技术解析表观耐药机制
小分子药物与基因组的结合构成了广泛的疾病治疗的分子基础，包括传统药物和靶向治疗。尽管大量的小分子药物通过与基因组互作的效果在临床治疗中得到了充分验证，但许多的小分子具体机制仍不清楚，耐药产生机制也尚未可知。绘制靶向基因组或染色质相关蛋白的药物多组学图谱，对于解读它们在抗癌治疗中的功能与耐药复发机制至关重要。迄今为止，只有少数技术能够在大量细胞群体（bulk）水平测量小分子与细胞基因组的互作【1-3】，...
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