张蔚课题组开发无需外类群的深度学习基因渐渗检测新方法
基因树与物种树之间的拓扑不一致广泛存在，主要源于祖先多态性导致的不完全谱系分选（incomplete lineage sorting）及基因渐渗（introgression）等过程。由于渐渗是适应性演化的重要来源，准确检测与定量历史基因流事件，并鉴定受渐渗影响的基因组区域，是演化基因组学研究中的重要问题。基于等位基因频率或系统发育关系的方法通常依赖外类群以确定祖先等位基因状态或根节点位置。然而，在实际研究中，选择合适的外类群往往具有挑战性。...
伊成器课题组与合作者建立基于AlphaFold3接触概率的人工智能框架，赋能精准碱基编辑
碱基编辑器是基础研究和疾病治疗的重要工具；但如何在保持高编辑活性的同时降低脱靶活性，始终是基因编辑领域的难题。是否能够利用人工智能模型提升基因编辑器的特异性，尚不明确。2026年7月22日，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心（CLS）、北京大学成都前沿交叉生物技术研究院伊成器课题组与华东师范大学生命科学学院李大力课题组在Nature合作发表题为Precise DNA base editing using AlphaFold3-based contact modelling的研究论文。...
曾泽贤/潘登合作开发空间转录组细胞分割模型 DISSECT，重建空间单细胞转录组
空间转录组技术能够在保留组织空间结构的同时测量基因表达，为解析复杂组织中的细胞组成、空间组织方式和细胞间相互作用提供了重要工具。近年来，成像型和测序型空间转录组技术快速发展，分子通量和空间分辨率不断提升，使研究人员能够在亚细胞甚至单细胞尺度上观察组织中的转录组分布。细胞分割是空间单细胞转录组重建的核心步骤。对于高分辨率空间转录组数据而言，如果细胞边界识别不准确，转录本就可能被错误分配到相邻细胞中，进而影响细胞类型注释、...
曾泽贤团队与合作者开发空转CRISPR Screen技术（SPAC-seq），让基因功能“看得见位置”
CRISPR screen通过对基因进行定向扰动，并直接观察细胞表型的变化，为研究基因功能与表型之间的因果关系提供了重要手段。随着单细胞测序技术的发展，Perturb-seq、CROP-seq等方法将单细胞转录组测序与CRISPR screen相结合，使研究人员能够在一次实验中获取更加丰富和精细的组学信息。近年来，空间组学技术的快速发展进一步推动了研究范式的转变，使科学家不仅能够关注细胞内部的基因表达变化，还能够解析细胞与细胞、细胞与微环境之间的空间关系。...
李毓龙实验室开发首个红色乙酰胆碱探针，实现多递质同步活体成像
乙酰胆碱（Acetylcholine, ACh）是人类发现的第一种神经递质，在中枢神经系统与外周神经系统中均扮演关键角色。它广泛参与注意力调控、运动控制、学习记忆、睡眠–觉醒周期，并与动机、奖赏、决策和情绪等核心行为密切相关。近年来，绿色荧光的ACh探针（如GRABACh2.0、GRABACh3.0 和iAChSnFR）已被报道并广泛应用，让研究者得以实时“看见”ACh的动态变化。然而，越来越多的证据表明，ACh作为大脑神经调控网络的重要成员，在发挥作用时往往伴随多巴胺（...
胡家志课题组发表抗体“点石成金术”，助力抗体高效定向进化
2026年05月06日，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心、北京大学成都前沿交叉生物技术研究院胡家志课题组在Genome Research发表了标题为：Restoring the potency of a neutralizing antibody via guided hypermutation with hyper-antibody editor HAE1的研究论文。该项研究中作者开发了用于抗体体外进化的高频抗体编辑器HAE1，并搭建了在哺乳动物细胞内可同时跨膜和分泌的抗体表达系统，成功实现了SARS-CoV-2突变体的逃逸抗体在胞内的定向进化过程，...
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