张蔚课题组与合作者揭示水平转移基因促进昆虫适应机制
半翅目叶蝉科昆虫具有刺吸式口器，主要取食维管植物的韧皮部汁液。因此，许多叶蝉不仅是重要的农业害虫，也是多种植物病原体的主要传播媒介，构成了研究昆虫、共生菌、植物与病原体之间复杂相互作用的理想系统。然而，叶蝉如何应对环境中的生物胁迫，如天敌捕食和病原体侵袭等挑战，其背后的适应机制仍缺乏深入认识。2026年10月15日，北京大学生命科学学院、基因功能研究与操控全国重点实验室、北大-清华生命科学联合中心、北京大学成都前沿交叉生物技术研究院张蔚研究组与合作者在iMeta期刊上发表了题为“...
王初课题组发展衣康酸修饰组学鉴定的通用型探针
近日，北京大学化学与分子工程学院、北大-清华生命科学联合中心、北大成都前沿交叉生物技术研究院王初课题组在J. Am. Chem. Soc.杂志上发表了题为“Cross-Species Profiling of Itaconate-Mediated Modifications by a Universal Probe”的论文。在这项工作中，作者发展了通用型衣康酸修饰化学探针，结合化学蛋白质组学技术，在哺乳动物细胞和细菌中实现了对衣康酸两种不同类型的翻译后修饰的鉴定，揭示了衣康酸通过共价修饰关键代谢蛋白调节其活性，...
来鲁华团队发展了基于大语言模型的可合成分子精准编辑方法SynCraft
人工智能技术在药物研发中发挥了越来越重要的作用，在药物研发的早期阶段生成式AI模型可以生成可能具有预设性质的大量全新化合物，为加速研发过程提供了新的途径。然而，虽然生成式AI模型可以产生大量具有多样性结构及高预测活性的新分子，但也常面临生成分子无法在现实实验室合成出来的难题，例如生成的分子包含不稳定片段、难以构建的环系或复杂的手性中心等，生成分子难以合成的问题已成为AI药物研发领域的主要瓶颈之一。如果直接剔除这些难合成的分子，...
韩敬东团队利用AURORA数字孪生平台发现抗衰老口腔共生菌Neisseria flavescens
衰老并非只发生在某个器官，而是分子、代谢、免疫、微生物与整体生理状态共同变化的系统过程。其中。肠道菌群已被视为调控健康寿命的重要力量；相比之下，同样与外界密切接触、且构成人体第二大微生物栖息地的口腔，其菌群是否也存在能够影响全身衰老的关键成员，仍缺乏系统研究。近年来，大量人工智能方法被开发以解决生命医学健康领域的重要科学问题，如构建虚拟细胞，建立多模态衰老时钟等。但是，如何从海量、多模态人群数据中高效发现个体化干预候选物，...
张蔚课题组开发无需外类群的深度学习基因渐渗检测新方法
基因树与物种树之间的拓扑不一致广泛存在，主要源于祖先多态性导致的不完全谱系分选（incomplete lineage sorting）及基因渐渗（introgression）等过程。由于渐渗是适应性演化的重要来源，准确检测与定量历史基因流事件，并鉴定受渐渗影响的基因组区域，是演化基因组学研究中的重要问题。基于等位基因频率或系统发育关系的方法通常依赖外类群以确定祖先等位基因状态或根节点位置。然而，在实际研究中，选择合适的外类群往往具有挑战性。...
伊成器课题组与合作者建立基于AlphaFold3接触概率的人工智能框架，赋能精准碱基编辑
碱基编辑器是基础研究和疾病治疗的重要工具；但如何在保持高编辑活性的同时降低脱靶活性，始终是基因编辑领域的难题。是否能够利用人工智能模型提升基因编辑器的特异性，尚不明确。2026年7月22日，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心（CLS）、北京大学成都前沿交叉生物技术研究院伊成器课题组与华东师范大学生命科学学院李大力课题组在Nature合作发表题为Precise DNA base editing using AlphaFold3-based contact modelling的研究论文。...
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