2026年单细胞ChIP-seq技术研讨实习班圆满落幕

由北京大学成都前沿交叉生物技术研究院（以下简称“北大成都院”）何爱彬实验室暨中国细胞生物学会发育生物学分会主办的“单细胞ChIP-seq技术研讨实习班”，于2026年3月23日在北大成都院圆满落幕。本次研讨实习班面向全国高校及科研院所免费招收了33位经各课题组导师推荐的学员，通过讲座与实验演示相结合的形式，全面推广了单细胞ChIP-seq的前沿技术。

何爱彬教授在开班仪式致辞

在3月20日晚的开班仪式上，北京大学未来技术学院教授、北大成都院PI、国家杰青何爱彬教授对各位科研工作者的到来表示欢迎与感谢，并简单介绍了研讨实习班的发展历程，本次研讨班筛选学员的原则，以及此次研讨会的主要内容。希望所有学员在未来几天的学习和交流中，能够掌握技术要领，不虚此行。

在题为“单细胞ChIP-seq技术的发展和应用”的开场主题报告中，何教授系统回顾了其团队在单细胞表观组学领域近十年来的原创性突破，详细介绍了从sc-itChIP-seq、CoBATCH等早期单组学工具，到CoTECH、uCoTarget (scEpiChem)、TACIT等超高通量高灵敏度多组学技术的研发进程，并展示了2026年最新的液体活检前沿成果 cf-EpiTracing。这些技术通过突破检测灵敏度与通量的瓶颈，实现了从单细胞全基因组覆盖到游离染色质精准溯源的跨越，不仅为揭示早期胚胎发育的复杂调控网络提供了强力支撑，更为非侵入性追踪疾病起源与临床精准转化开辟了全新平台。

何爱彬教授解答学员现场提问

艾珊珊教授和李晨为学员们介绍了itChIP-seq技术的实验原理及操作详解。她们从实验原理出发，详细解析了全流程操作规范。报告重点分享了实验条件的优化经验，包括如何控制Tn5转座酶活性、PCR引物的选择策略以及文库构建中的关键细节。此外，他们还介绍了如何通过凝胶电泳和文库浓度分析对实验结果进行质量校验，确保获得高信噪比的测序数据。

艾珊珊教授讲解itChIP技术实验原理及操作/李晨讲解itChIP技术实验原理及操作

张彤和孟晓萱深入剖析了uCoBATCH及uCoTarget（scEpiChem）的技术原理和实验操作。他们重点讲解了基于Protein A-Tn5融合蛋白的创新建库策略，详细介绍了Split-pool（组合条码）策略的操作流程，展示了如何通过多轮索引实现超高通量的单细胞标记。该技术不仅提升了检测效率，更为研究复杂组织中的表观遗传异质性提供了高效的实验方案。

张彤讲解uCoBATCH技术实验原理及操作/孟晓萱讲解uCoTarget技术实验原理及操作

刘敏介绍了具备超高基因组覆盖度的TACIT和CoTACIT技术。针对单细胞数据稀疏这一行业痛点，刘敏展示了TACIT技术如何实现单细胞内的高检测灵敏度。她还分享了针对超低起始量样本的优化技巧，例如采用离心代替传统的ConA磁珠固定方案以减少样本损耗，并实现在同一离心管内完成所有生化反应的高效流程。

熊海清教授从生物信息学的角度，为学员们系统培训了单细胞ChIP-seq的数据分析流程。他详细讲解了评价数据质量的关键指标，如FRiP（峰内reads占比）、灵敏度及碰撞率（Collision rate）等。同时，熊教授还演示了从原始测序数据处理、比对、去重到下游的聚类、UMAP可视化及基因活性评分的完整分析流程，帮助学员掌握从实验数据到科学发现的转化路径。

刘敏讲解TACIT/CoTACIT技术实验原理及操作/熊海清教授讲解单细胞ChIP-seq技术的质控和分析流程

3月21日至22日，为期两天的实战演示环节在北大成都院710实验室密集展开。由艾珊珊教授、李晨、刘敏、孟晓萱、张彤、李鑫和吴菲组成的讲师团，针对各项核心技术的全流程操作进行了多场并行演示。讲师们对每一处关键实验细节均进行了“倾囊相授”式的现场教学。这种理论与实操深度融合的教学模式，让学员们在直观的实验观察中破解了长期困扰课题研究的技术瓶颈。学员们纷纷表示，此次“沉浸式”的学习不仅让他们在理论上“吃透”了前沿技术，更在实操层面积累了宝贵的经验。

在结营仪式上，何爱彬教授及讲师团就学员在前几天的学习过程中遇到的问题再次开展了集中答疑。此外，何爱彬教授团队进一步展示了对技术推广的无私态度，宣布实验室将通过与北大成都院共同孵化的公司——成都宜溯生物技术有限公司（EpiTrees），为学员提供核心试剂PAT酶的试用申请机会，助力原创单细胞表观组学技术在全国科研一线真正落地生根，为生命科学研究注入更多创新活力。

何爱彬教授在结营仪式上与学员交流互动

【致谢】

本次研讨实习班的成功举办得到了北大成都院、中国细胞生物学会发育生物学分会、以及成都宜溯生物技术有限公司等单位的大力支持。

【学员心声】

我是来自南方科技大学温子龙组的博士学生，第一次深入接触单细胞表观组学是来自何教授的讲座，老师深入浅出的讲解让我对这一前沿领域非常着迷，并一下子捕捉到它在自身课题中的应用前景。而这次何老师提供的宝贵机会，让我从理论基础出发，通过强大讲师团队的详细、毫无保留的讲解，逐步吃透。更为难得的是，何老师联合企业无私提供试剂试用机会，让我们能够学以致用。真是一次无价之旅！

——王佑琪，南方科技大学温子龙课题组

有幸参加本次单细胞 ChIP 专题研讨会，系统学习了何老师课题组自主研发的 CoBATCH 与 TACIT 技术，全程收获颇丰。通过本次学习，我对何老师团队原创技术体系的设计思路、科学问题切入点及核心创新点有了更为系统和深刻的理解。期间，各位带教师兄师姐热情耐心、经验丰富，对实验原理、关键步骤与实操细节进行了细致讲解与点拨，有效解决了我在技术理解与应用中的诸多困惑，令我受益匪浅。同时，我也与来自不同单位、同领域的优秀同学充分交流，大家结合自身科研实践分享经验、碰撞思路，不仅拓宽了学术视野，也为后续课题设计与研究开展提供了诸多启发。

——黄邦卓，复旦大学罗凌飞课题组

本次单细胞ChIP-seq研讨班让我受益良多，收获满满。很感谢授课老师和助教老师们的无私分享和耐心教导，让我对这个技术的发展和应用有了深刻的认识，也对uCoTarget等实验的流程有了整体而详细的理解。对于技术的实操方面，由于时间限制，没有看到早期PAT构建和后期建库的实操流程，有所遗憾，如果可以视频介绍也是不错的选择。本次对老师和助教们我都打满分，无可挑剔。本次的研讨会中和各位同学的交流也让我收获了新知识，开拓了新视野，非常开心和不同领域不同方向的同学们交流知识。希望这个研讨会能够一直开下去，越来越好。

——幸运至，厦门大学周大旺课题组

这次来参加研讨班，最大的感受就是老师们真的很实在，讲得细，还免费教学、免费送酶，确实挺难得的。跟全国各地的同学一起学习，交流了一下各自做的课题，也学到了不少。特别感谢助教们，帮我解答了最近实验里遇到的一个具体问题，很专业，也很耐心。

——张莹，四川大学许文明课题组

非常荣幸能参加本次的单细胞ChIP-seq培训班，十分感谢何老师的无私奉献以及讲师们的细心教学，通过本次培训，不仅学习了新技术，也结识到了领域内的同学，希望往后的类似培训越办越好，大家能更广泛使用单细胞ChIP-seq技术，也祝Helab越来越好。

——范训安，华南理工大学费继锋组

非常感谢HeLab老师和学生的倾囊相授。亲爱的导问我是否想去最高学府培训，我积极响应，于是从北京坐了一夜火车来到北京大学成都院。之前对于表观、染色质、单细胞等概念只知皮毛，经此次培训有了更深的认识。无论是对于少量细胞使用口吸进行精密分选，还是对于大量细胞巧妙进行分批随机标记，HeLab在单细胞技术领域的创新也对我有巨大的启发。看到本次培训期间，HeLab不同阶段的学生齐聚一堂，氛围其乐融融，可以知道这是一个充满活力的集体，他们一定能够做出更加具有开创性的重要工作。此外，我也有幸从宜溯体会到北大成都院产研结合的巨大成就。

——马润博，清华大学吝易课题组